革命性的第三代測序?---全長(cháng)轉錄組,微生物基因組,基因組de novo
?第三代基因測序技術(shù)又被為 “Single Molecule Real Time (SMRTTM) DNA Sequencing”(單分子實(shí)時(shí)DNA測序技術(shù)),該方法基于納米孔的單分子讀取技術(shù),不需要擴增即可快速讀取序列。目前,Pacific Biosciences 公司已經(jīng)成功推出了商業(yè)化的第三代測序儀PacBio RS平臺,使得第三代測序正式走入人們的視角。?
技術(shù)優(yōu)勢:?
??更長(cháng)的測序讀長(cháng) (平均讀長(cháng)可超過(guò)10000 bp,有超過(guò)50%的讀長(cháng)大于14000 bp),可大幅提高定位準確性及拼接效率,有利于闡釋基因組所發(fā)生的變異以及大尺度結構重排等信息并發(fā)現其相關(guān)的生物學(xué)意義。
??單分子實(shí)時(shí)檢測,模板制備時(shí)無(wú)需PCR擴增,每一條模板鏈都可獲得相應序列信息,數據覆蓋均勻,準確;可以檢測稀有變異;
??可同時(shí)獲得動(dòng)力學(xué)信息,可進(jìn)行甲基化等修飾堿基的直接測定;
??覆蓋深度幾乎不受序列中GC/AT含量差異的影響;
??從樣本制備到獲取序列信息簡(jiǎn)便快捷;
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參考文獻
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